Zber údajov - predchádza rozhodnutie, či sa potrebné údaje budú získavať vyšetrovaním vybraných osôb, alebo či sa použijú údaje už v minulosti zozbierané, eventuálne publikované v oficiálnych správach, ročenkách a podobne. Základom pre zber údajov je rozhodnutie, ktoré údaje sa budú zbierať, v akých jednotkách a akou formou sa budú zapisovať a nakoniec ako sa technicky zabezpečí ich uloženie do databázy.
Ak sa údaje zbierajú pomocou dotazníka, tento musí mať všetky náležitosti pre žiadanú validitu a kvalitu údajov (viď Dotazník). Všetci, ktorí sa zúčastňujú zberu údajov, by mali vedieť ciele epidemiologického sledovania a všetky požiadavky na zabezpečenie štandardnosti získania, zaznamenania a skladovania údajov.