Sú to malé, jednomembránové organely. Vznikajú z endoplazmatického retikula alebo Golgiho aparátu. Majú prevažne katabolickú funkciu.

Lyzozómy a peroxizómy obsahujú tráviace enzýmy – kyslé hydrolázy. Tieto enzýmy môžu rozkladať bielkoviny, nukleové kyseliny, lipidy aj karbohydráty za kyslých podmienok. Získané jednoduchšie komponenty makromolekúl sú uvoľňované do cytoplazmy, kde sa opäť využijú na syntézu nového materiálu. Kyslé hydrolázy sú syntetizované v endoplazmovom retikule, transportované ku Golgiho aparátu na ďalšiu úpravu a následne transportované k lyzozómom.

Lyzozómy je možno nájsť takmer vo všetkých bunkách, najmä však v tých tkanivách, ktorých bunky vykazujú časté mitózy, ako napr. pľúca, pečeň, slezina a leukocyty.

Lyzozómy sa považujú za „tráviaci aparát” bunky, pretože môžu pohltiť a rozložiť komplexné molekuly, mikroorganizmy a poškodené časti buniek (bunkový detritus). Chýbanie čo len jedinej kyslej hydrolázy v lyzozómoch môže znamenať vážnu genetickú chorobu, pretože cudzí materiál, ktorý vnikne do bunky, nemôže byť natrávený a eliminovaný.