Kaplan-Meierova krivka a log-rank test v programovom prostredí R
 
 
Step: Jednoduchá Coxova regresia...
  Jednoduchá Coxova regresia
Potom príkaz bude vyzerať nasledovne:
coxph(Surv(cas,pozorovana_udalost)~
premenna_porovnavania, data=nazov_objektu)

Vysvetlivky k príkazom

cas - sledovaný čas od začiatku pozorovania do nastania pozorovanej udalosti
pozorovana_udalost - binárna premenná, výskyt pozorovanej udalosti
premenna_porovnavania - kategorická premenná, medzi kategóriami uskutočňujeme porovnávanie prežívania
nazov_objektu - názov objektu/ databázy s údajmi
Príklad
Bol realizovaný randomizovaný trial pre nový typ liečby nádoru pľúc. Výskumník chcel zistiť, či má nový typ liečby v porovnaní so štandardnou liečbou (premenná trt) významný vplyv na prežívanie pacientov.
 coxph(Surv(time,status)~trt, data=veteran)

H0: Neexistuje štatisticky významný rozdiel v prežívaní pacientov so štandardnou liečbou a s novým typom liečby.
HA: Existuje štatisticky významný rozdiel v prežívaní pacientov so štandardnou liečbou a s novým typom liečby.

Hypotézy testoval na hladine významnosti 0,05. Výskumník zistil, že neexistuje štatisticky významný rozdiel v prežívaní pacientov so štandardnou liečbou a s novým typom liečby (p> 0,05).
 
 
Step: Viacnásobná Coxova regresia...
  Viacnásobná Coxova regresia
Potom príkaz bude vyzerať nasledovne:
coxph(Surv(cas,pozorovana_udalost)~
premenna_porovnavania1+ premenna_porovnavania2+ premenna_porovnavania3+ premenna_porovnavania4+… + premenna_pozorovaniax, data=nazov_objektu)
Vysvetlivky k príkazom

cas - sledovaný čas od začiatku pozorovania do nastania pozorovanej udalosti
pozorovana_udalost - binárna premenná, výskyt pozorovanej udalosti
premenna_porovnavania - kategorická premenná, medzi kategóriami uskutočňujeme porovnávanie prežívania
nazov_objektu - názov objektu/ databázy s údajmi
Príklad
Bol realizovaný randomizovaný trial pre nový typ liečby nádoru pľúc. Výskumník chcel zistiť, či má nový typ liečby v porovnaní so štandardnou liečbou (premenná trt) významný vplyv na prežívanie pacientov. Okrem typu liečby zobral výskumník do úvahy aj vplyv typu nádorových buniek (celltype), výkonnosti pacientov (karno- Karnofsky performance score) a času, ktorý uplynul od diagnostikovania ochorenia do zahrnutia do výskumu (diagtime) na prežívanie pacientov.

H0: Neexistuje štatisticky významný rozdiel v prežívaní pacientov so štandardnou liečbou a s novým typom liečby, ak zoberieme do úvahy aj vplyv ostatných faktorov.
HA: Existuje štatisticky významný rozdiel v prežívaní pacientov so štandardnou liečbou a s novým typom liečby, ak zoberieme do úvahy aj vplyv ostatných faktorov.

Hypotézy testoval na hladine významnosti 0,05. Výskumník zistil, že neexistuje štatisticky významný rozdiel v prežívaní pacientov so štandardnou liečbou a s novým typom liečby (p> 0,05) aj keď zobral do úvahy vplyvy typu nádorových buniek, výkonnosti pacientov a času, ktorý uplynul od diagnostikovania ochorenia do zahrnutia do výskumu.